Karmel Miłości Miłosiernej w Szczecinie powstał na prośbę Ks. Arcybiskupa Kazimierza Majdańskiego, ówczesnego pasterza diecezji szczecińsko-kamieńskiej,
z fundacji częstochowskiej 25. marca 1983 r. Pierwsze Siostry zamieszkały początkowo w dwóch pustelniach: Najśw. Serca Pana Jezusa i Matki Bożej Samotności. Budowę klasztoru rozpoczęto w maju 1986 roku.
W lipcu 1989 roku wspólnota przeniosła się do oddanej do użytku części klasztoru. 13 grudnia 1990 r. została konsekrowana kaplica, 30 marca 1991 r.
Ks. Arcybiskup Kazimierz Majdański za zgodą Stolicy Apostolskiej dokonał kanonicznej erekcji klasztoru.
Tytulacja klasztoru przywołuje Osobę Ducha Świętego jako Miłość Miłosierną. Duchową inspiracją powstania szczecińskiego Karmelu była encyklika Ojca Św. Jana Pawła II o Bożym Miłosierdziu „Dives in Misericordia” z jej wołaniem o zaangażowanie się w budowanie cywilizacji życia i miłości. Czując wezwane do włączenia się w ten nurt, mniszki zawierzyły nowy klasztor Duchowi Świętemu - Temu, który jest „Miłością pełną miłosierdzia, zdolną wydobyć dobro spod wszelkich nawarstwień zła”.